Коронавирус, полное название которого звучит как SARS-COV-2 – коварен и загадочен.
Врачи уже отметили, что симптомы вызываемой им болезни разнообразны, а портрет типичной жертвы не так уже и очевиден, как казалось раньше. От него умирают, как молодые, так и пожилые. Как хронически больные, так и вполне себе здоровые люди.
Компания 23andMe, созданная Энн Воджицки, решила использовать свою уникальную базу генетических данных, чтобы выявить возможную связь между ДНК больных и уязвимостью к вирусу, об этом рассказывает издание Wired.
23andMe: почему от коронавируса так часто умирают?
Компания потребительской геномики 23andMe имеет в своем распоряжении базу данных из миллионов клиентов.
Специалисты компании уже пришли к выводу, что вирус одинаково заражает людей вне зависимости от их возраста, расы и пола. Это логично, поскольку мы имеем дело с совершенно новым болезнетворным микроорганизмом, от которого ни у кого нет иммунитета.
Проблема в том, что вирус ведет себя непредсказуемо.
При этом серьезно заболевают далеко не все инфицированные люди. При этом у заболевших очень разные симптомы: у кого-то высокая температура и кашель, у кого-то желудочные колики и диарея, кто-то теряет аппетит, а кто-то перестает различать запахи.
При этом кто-то способен преодолеть недуг, сидя дома, потребляя много жидкости и радуя себя сериалами. А кто-то попадает в реанимацию, где к нему подключают множество трубок, которые безуспешно качают воздух в его больные легкие, пишет Wired.
Большинство летальных исходов это пожилые люди с хроническими заболеваниями и мужчины. Но не всегда.
В США большой процент госпитализированных с серьезными симптомами — это люди моложе 40 лет. Дети, особенно грудного возраста, тоже не защищены на сто процентов.
Чтобы понять, чем вызваны такие различия, ученые продолжают изучать обрывочные эпидемиологические данные, поступающие из очагов заражения, таких как Китай, Италия и США. Они ищут особенности и закономерности в возрасте пациентов, их расе, поле, социально-экономическом положении, поведении и в доступности для них медицинских услуг. Теперь они копают глубже, стараясь отыскать отгадки также и в нашей ДНК.
В настоящее время компания 23andMe пытается найти генетические различия, которыми можно объяснить, почему у заболевших Covid-19 людей такая разная реакция на инфекцию.
Проведенные ранее исследования показывают, что некоторые варианты генов при заболевании определенными инфекционными болезнями подвергают людей повышенной опасности. Другие же обеспечивают им защиту, скажем мутация гена CCR5, делающая носителя невосприимчивым к ВИЧ. Пока еще рано говорить о том, насколько существенно ДНК защищает от Covid-19 или наоборот, делает человека уязвимым. Однако полученную информацию можно будет когда-нибудь использовать для выявления людей, в большей степени подверженных риску заражения, а также для целенаправленного поиска новых лекарств и методов лечения.
«Мы хотим понять, как наши гены влияют на нашу реакцию на вирус, – отметила вице-президент компании 23andMe по исследовательской работе Джойс Танг (Joyce Tung). – У нас есть надежда, что собрав данные у людей, которым сделали анализы и поставили диагноз Covid-19, мы сумеем узнать что-то о биологических особенностях этого заболевания и помочь научному сообществу успешнее лечить заболевших».
23andMe может исследовать геном примерно восьми миллионов человек. Огромный объем данных, которыми располагает компания, делает ее мощным источником информации из области генетических исследований.
Последний опрос, опубликованный на сайте 23andMe, включает вопросы о том, где живет человек, какие меры социального дистанцирования он соблюдает, проверялся ли он на коронавирус, контактировал ли с инфицированными, и ставили ли ему диагноз Covid-19. Таким образом 23andMe надеется привлечь к исследованию сотни тысяч своих клиентов, включая тех, кому поставлен диагноз Covid-19, у кого тест дал отрицательный результат, у кого есть похожие на грипп симптомы, но кто проверку пока не проходил, а также членов семей инфицированных.
“Для людей с положительным результатом теста проведут дополнительный опрос о тяжести болезни, о проявлении симптомов и о том, были ли они госпитализированы”, – рассказал главный научный сотрудник компании Адам Отон (Adam Auton), который возглавляет новое исследование Covid-19. “Всех участников будут каждый месяц приглашать на новый опрос с дополнительными вопросами, благодаря чему 23andMe сможет выявлять новые случаи заболевания среди респондентов”.
Сейчас задача компании – собрать достаточное для проведения исследования количество ответов у людей, заразившихся Covid-19, правда, только на территории США.
После того, как данные будут собраны, исследовательская команда проведет статистический анализ под названием полногеномный поиск ассоциаций (GWAS). Этот метод сегодня широко используется в генетических исследованиях.
При проведении GWAS людей делят на разные группы, в случае с COVID-19, видимо, на основании симптомов. После этого будет проведено сканирование данных их ДНК с тем, чтобы выяснить, проявляются ли определенные однобуквенные вариации в генетическом коде чаще среди людей с определенными симптомами.
“Никто не знает, какие гены удастся найти во время этих экспедиций по поиску ДНК. Но многие из них наверняка отметятся в тех частях генома, которые отвечают за иммунную реакцию организма, – говорит Майк Снайдер (Michael Snyder), возглавляющий кафедру генетики в Стэнфордском университете. «В общем мы знаем, что генетика влияет на ход вирусной инфекции. В этом нет ничего неожиданного, так как в процессе исторического развития люди в различных условиях окружающей среды подвергались воздействию вполне определенных патогенов. Вполне логично, что у разных людей иммунные системы настраиваются по-разному».
Интересно, что чрезмерная защитная реакция организма, известная как гиперцитокинемия, вызвала немало смертей среди больных атипичной пневмонией. Есть подозрения, что гиперцитокинемия является также причиной некоторых летальных исходов среди молодых людей, заболевших Covid-19.
В научных лабораториях по всему миру реализуется уже свыше 90 таких проектов секвенирования, во время проведения которых ученые как можно быстрее пытаются понять почему вирус унес жизни уже десятков тысяч людей.
Так, Исландская компания DeCODE Genetics, которая на протяжении десятилетий занимается сбором данных о геномах и состоянии здоровья 364 000 жителей этой островной страны, получила от правительства разрешение на публикацию результатов анализов на Covid-19.
Чтобы объединить все генетические данные, поступающие от различных исследовательских коллективов, ученые из Хельсинкского университета недавно создали координационный информационный центр под названием «Генетика носителей Covid-19».
Photo by National Cancer Institute on Unsplash
